Lincoln surgiu como um produtor independente de automóveis de luxo em 1917. Fundada pelo engenheiro Henry M. Leland após a sua partida da Cadillac, que tinha ajudado a co-fundar, a empresa foi nomeada Lincoln como lembrança da admiração que Leland nutria pelo agora extinto líder do estado. Numa macabra coincidência, o presidente JFK foi assassinado, tal como Abraham Lincoln foi. Na altura da sua morte, JFK estava a ser conduzido numa limusina Continental de Lincoln.

Contudo, antes de tal drama ocorrer, Lincoln era uma companhia bastante pequena que fornecia motores de aviões Liberty para o Exército durante a Primeira Guerra Mundial. Tendo-se juntado ao filho Wilfred, Leland converteu a sua fábrica à fabricação de automóveis de luxo logo após a guerra. Apesar da habilidade e potencial de Leland dos seus veículos, a fábrica encontrou vários obstáculos relacionados com o design e problemas financeiros que não puderam ser ultrapassados. Forçado à falência, Leland vendeu a sua empresa à Ford em 1922 por $8 milhões.

Logo após a aquisição da Ford, a primeira série de automóveis de Lincoln entraria na produção em massa. Sob a Ford, os problemas de estilo da Lincoln foram resolvidos, tal como os problemas financeiros experimentados anteriormente. Poucas ou nenhumas alterações foram feitas aos motores originais da Leland. Juntamente com os cortes nos custos de produção, isto permitiria à empresa ter cerca de 5.500 veículos em Dezembro de 1922.

A partir de 1923, surgiram novos estilos de corpo, muitos dos quais foram o resultado de parcerias com construtores de autocarros como Fleetwood e Brunn. Isto levou ao aparecimento de uma gama diversificada de veículos composta por grandes sedans e limusines que podiam acomodar até 7 passageiros. Apesar das etiquetas de preço bastante grandes com que estes veículos especiais construídos em carroçaria vieram acompanhados, as vendas da Lincoln não caíram a pique. Pelo contrário, registaram um aumento espectacular de 45% em relação aos anos anteriores com 7.875 veículos vendidos.

Os de 1924 deram origem à libertação dos famosos Flyers que foram amplamente utilizados pelos Departamentos de Polícia dos EUA. Os carros estrearam algumas características que só foram introduzidas em modelos privados 2 anos depois. Dois discos de rodas, suportes de armas, janelas blindadas e apitos da polícia estavam entre os muitos 'acessórios' que os Flyers vieram equipados com.

Provavelmente o carro mais famoso alguma vez fabricado por Lincoln germinou em 1932, o desenho de Eugene T. "Bob" Gregorie. O posterior lançamento do Zephyr em 1936 abriu os portões para o lançamento do Continental. Este último foi na realidade um Zephyr Coupe modificado em 1938 a quem Gregorie tinha seccionado e acrescentado uma montagem vertical de pneu. O carro teve tanto sucesso que foi vendido em mais de 5000 unidades até que a produção foi interrompida em 1948.

No entanto, o continente não se afundaria definitivamente. Mais tarde, foi ressuscitado através do modelo Mark II. Em 1955, o Mark II podia ser comprado por uns impressionantes 10.000 dólares, tanto quanto um Rolls Royce custava nesses dias.

Desenhos posteriores, como o Town Car e o volumoso Navigator, ajudaram a Lincoln a tornar-se a marca de carros de luxo mais vendida nos EUA em 1998. Após uma breve mudança de propriedade entre 1998 e 2002, quando a Lincoln pertenceu ao Premier Automotive Group, a empresa regressou às instalações da Ford, onde ainda hoje se pode encontrar.

Apesar da sua tradição como fabricante de automóveis de luxo e fornecedor de limusinas presidencial, a empresa sofreu um grave revés nos últimos anos, tendo perdido contra as importações asiáticas e europeias. Isto deve-se principalmente à falta de novos modelos, questão que a Ford espera resolver reinventando a marca. A ascensão de Lincoln ainda está por resolver através do lançamento de modelos como o MKZ e o MKX.