Com sede na República Checa, a Skoda Automobile foi criada por um proprietário de livraria insatisfeito e pelo seu irmão e começou como uma loja de reparação de bicicletas em 1895. Vaclav Laurin e o seu irmão iniciaram o negócio quando não conseguiram arranjar as suas bicicletas alemãs devido à falta de peças. Decidiram chamar a empresa Slavia devido a um impulso patriótico. Mais tarde, foi mudada para Laurin & Klement Co. e começou a fabricar motocicletas.
Depois de várias vitórias em corridas locais, os dois concorrentes decidiram exportar as suas motocicletas para Londres. Com base no sucesso do primeiro modelo, Voiturette A, Laurin e Klement expandiram-se para a fabricação de automóveis a partir de 1905. Por essa altura foram estabelecidos como uma grande empresa tanto local como internacional.
A Primeira Guerra Mundial significou que a fábrica estava agora envolvida na produção de guerra, mas assim que esta terminou, a empresa retomou a produção de automóveis. Em 1924 fizeram uma fusão com a Skoda Works, um conglomerado industrial e começaram a fabricar camiões. Este é o momento em que todos os produtos saíram com o nome Skoda.
A Segunda Guerra Mundial trouxe a ocupação alemã que colocou Skoda na posição de produzir para apoiar o esforço de guerra nazi. A produção civil foi inicialmente limitada e depois suspensa por completo. Após a guerra, a empresa foi afectada pelo programa de nacionalização dirigido pelo governo e ficou conhecida como a empresa AZNP em 1946. A única vantagem foi o facto de ter obtido o monopólio da fabricação de automóveis de passageiros.
Os modelos deste período incluem a série 1101 (uma versão actualizada do Skoda Popular), a Spartak 440, 445 Octavia, Felicia e 1000 MB. Com o passar do tempo, Skoda perdeu o contacto com o Ocidente, o que provocou uma ruptura no desenvolvimento. Em breve, a maioria dos modelos Skoda tornaram-se desactualizados e à medida que outras empresas automóveis aumentavam em vendas e modelos, Skoda era estritamente controlada pelo Estado.
Só depois da crise económica dos anos 70 é que a Skoda conseguiu obter algum sucesso com o novo Skoda Favorit, em 1987. Este modelo concebido pela empresa italiana Bertone e com tecnologia de motores ocidental vendida notavelmente bem na Europa de Leste e também no Reino Unido, sabendo-se que os Skodas eram geralmente carros fiáveis.
Com a queda do regime comunista em toda a Europa, o governo checoslovaco estabeleceu novas condições de economia de mercado, o que permitiu à Skoda procurar um parceiro estrangeiro para o ajudar a crescer.
Em Dezembro de 1990, a Skoda associou-se ao Grupo Volkswagen, e tornou-se efectiva a 16 de Abril de 1991. Com a tecnologia alemã ao seu lado, a Skoda conseguiu aumentar a qualidade dos seus automóveis e, desde então, tornou-se um actor importante no mercado automóvel europeu.
Tendências recentes viram o fabricante checo de automóveis mudar-se para um mercado ligeiramente mais luxuoso com o Superb e o Octavia. A empresa está também a tentar assegurar outros segmentos do mercado com o MPV 2006 chamado Roomster e um conceito de cruzamento chamado Yeti.